Hola @marcmn1.
Gracias por utilizar los foros como consulta.
Necesitaría, saber si tienes acceso al techo por la parte superior, por que a la hora de poner cualquiera de las 2 opciones seria indispensable.
La otra seria si puedes hacerle alguna foto más para ver como tienes estructurados los soportes y la separación entre ellos.
Y hora contestando un poco a tu pregunta. Las planchas de policarbonato son muy buenas y pueden dejarte pasar mucha luz bajo ese techado, pero al ser de un material plástico, si sabes que arrojan elementos punzantes o cosas parecidas, podrían romperse y tener fisuras por donde entre el agua. Por otra parte, las chapas ondulas son muy resistentes y al ser un material galvanizado resisten perfectamente las lluvias, por lo que considero que son mejor opción en ese caso.
Espero haberte ayudado y espero que nos digas porque opción te declinas y poder ayudarte en todo lo que podamos.
Un saludo.
Si crees que puedes, puedes.